11 марта 1950 года в здании на Сибирском проспекте, 38 была прочитана первая публичная лекция.
Хотя готовиться к открытию в учреждении начали осенью 1949 года.
Планетарий всё это время размещается в здании Крестовоздвиженской церкви 1908 года постройки. Церковь была закрыта ещё в 1939 году, а бывшее кладбище, где она находилась, стало парком.
В апреле 2019 года завершился многолетний процесс передачи здания планетария в подчинение РПЦ. По условиям передачи Барнаульский планетарий продолжит свою работу на привычном для горожан месте до 2021 года. За это время в мэрии Барнаула должны определиться с его новым месторасположением.