В 2021 году на счета Тонояна и его родственников поступали большие суммы. В общей сложности почти 80 млн рублей. Это не соответствовало официальному доходу семьи за три последних года. Прокуратура направила в суд иск об изъятии этих денег в доход государства. Требования удовлетворили. Также наложен арест на недвижимость и автомобили.
Армен Тоноян стал фигурантом уголовного дела летом 2022 года. Он обвинялся в мошенничестве, совершённом организованной группой либо в особо крупном размере. В январе этого года его приговорили к пяти годам лишения свободы и штрафу в 950 тысяч рублей.