Занесённая в Красную книгу России остроухая ночница - доминирующий вид среди всех зимующих на Алтае мышей. Второе место по численности занимают восточные ночницы, сибирские трубконосы. Встречаются ушаны Огнёва и другие представители семейства рукокрылых. В некоторых местах обитания летучих мышей специалисты разместили датчики температуры, влажности и фотоловушки. Эксперты еще собрали пробы, которые позволят определить, заражены ли животные опасными для человека инфекциями. Летучих мышей также «очесали» на наличие у них эктопаразитов - блох и клещей.