Основная задача центра – изучение истории и культуры Большого Алтая, расположенного на территории России, Китая, Казахстана и Монголии. К работе привлекаются учёные из этих стран, налажено сотрудничество с 20 научными центрами. Под эгидой «Большого Алтая» разрабатываются проекты по строительству международных связей и эффективному совместному использованию экономических ресурсов.
Ещё одна задача – создание сетевых образовательных программ. Со следующего года в опорном университете начнут обучать российских и иностранных студентов по программам, разработанным ведущими тюркологами России и соседних государств.
Подготовлено шесть международных образовательных магистерских программ. Они касаются наиболее интересных, наиболее проблемных, наиболее востребованных тем, компетенций, которые мы можем дать будущим студентам центральноазиатских университетов. Это историко-археологическое направление, этнография и культура, правовые обычаи, государственность, этно-религиозная ситуация, социальные условия, миграция, молодёжь.